Eesti Keskkonnaühenduste Koda on aastaid esitanud RMK sertifitseerijale NEPConile näiteid haruldaste ja ohustatud liikide elupaikade kahjustamisest, siiani pole see RMK tegevuses paraku olulisi muutusi kaasa toonud. Viimane näide RMK hoolimatust tegevusest haruldaste ja ohustatud liikide elupaikades oli kanakulli pesametsa raie Kurgjal.
RMK on siiani põhjendanud FSC auditite käigus ja avalikkuses oma tegevuse vastavust säästva metsanduse põhimõtetele asjaoluga, et Keskkonnaamet (KeA) on ohustatud liikide elupaikades tegevuseks loa andnud ja seda on ka järgitud. Vaatame siis lähemalt, millised need piirangud on ning kuidas seadus liikide kaitset käsitleb.KeA peab seadma kaitstavate liikide elupaikades piiranguid vastavalt Looduskaitseseadusele (LKS), mis kaitsealuste liikide kohta ütleb järgmist: I ja II kaitsekategooria taimede ja seente kahjustamine, sealhulgas korjamine ja hävitamine, on keelatud. III kaitsekategooria taimede, seente ja selgrootute loomade hävitamine ja loodusest korjamine ulatuses, mis ohustab liigi säilimist selles elupaigas, on keelatud.
